Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnbip1Q9JJN6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.5 ms