Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Oxct2aQ9JJN4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oxct2aQ9JJN4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms