Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efcc1Q9JJF6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efcc1Q9JJF6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms