Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ5

Tfap4, Activator protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap4Q9JIZ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfap4Q9JIZ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tfap4Q9JIZ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfap4Q9JIZ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms