Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ppp1r3fQ9JIG4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ppp1r3fQ9JIG4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppp1r3fQ9JIG4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms