Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Copb1Q9JIF7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Copb1Q9JIF7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms