Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn12Q9ET43 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms