Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf13bQ9ET35 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms