Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESL0

Oxct2b, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2bQ9ESL0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oxct2bQ9ESL0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Oxct2bQ9ESL0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Oxct2bQ9ESL0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms