Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3bQ9ES34 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube3bQ9ES34 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3bQ9ES34 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms