Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trhr2Q9ERT2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trhr2Q9ERT2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trhr2Q9ERT2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trhr2Q9ERT2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms