Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dap3Q9ER88 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dap3Q9ER88 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms