Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Clstn2Q9ER65 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Clstn2Q9ER65 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Clstn2Q9ER65 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Clstn2Q9ER65 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms