Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r46Q9EQ45 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms