Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcr6Q9EQ16 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms