Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cpsf1Q9EPU4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpsf1Q9EPU4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms