Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r63Q9EPT1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r63Q9EPT1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r63Q9EPT1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms