Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rp2Q9EPK2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rp2Q9EPK2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms