Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r53Q9EP93 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms