Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aph1cQ9DCZ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms