Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bap18Q9DCT6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bap18Q9DCT6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bap18Q9DCT6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms