Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eif3fQ9DCH4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3fQ9DCH4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms