Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MNCb-2875Q9DCB3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms