Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cpne8Q9DC53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne8Q9DC53 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpne8Q9DC53 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpne8Q9DC53 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpne8Q9DC53 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpne8Q9DC53 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms