Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok3Q9DBU3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms