Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ftsj3Q9DBE9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ftsj3Q9DBE9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms