Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SelenooQ9DBC0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SelenooQ9DBC0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms