Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fundc1Q9DB70 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fundc1Q9DB70 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fundc1Q9DB70 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fundc1Q9DB70 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fundc1Q9DB70 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fundc1Q9DB70 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fundc1Q9DB70 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms