Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms