Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9D9H8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9D9H8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q9D9H8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Q9D9H8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Q9D9H8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9D9H8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9D9H8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q9D9H8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q9D9H8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q9D9H8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9D9H8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms