Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D9D9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D9D9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D9D9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms