Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D8L0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D8L0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms