Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp4bQ9D8B3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp4bQ9D8B3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms