Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arpc5lQ9D898 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arpc5lQ9D898 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms