Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan17Q9D7W4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan17Q9D7W4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms