Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D7E4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D7E4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D7E4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D7E4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D7E4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D7E4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D7E4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D7E4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D7E4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D7E4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms