Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn23Q9D7D7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn23Q9D7D7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms