Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PirQ9D711 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PirQ9D711 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PirQ9D711 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PirQ9D711 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PirQ9D711 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PirQ9D711 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PirQ9D711 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PirQ9D711 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PirQ9D711 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PirQ9D711 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PirQ9D711 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PirQ9D711 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PirQ9D711 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PirQ9D711 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PirQ9D711 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PirQ9D711 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
PirQ9D711 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PirQ9D711 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PirQ9D711 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PirQ9D711 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PirQ9D711 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PirQ9D711 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PirQ9D711 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms