Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ndufb8Q9D6J5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb8Q9D6J5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms