Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc94Q9D6J3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc94Q9D6J3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms