Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip1Q9D620 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip1Q9D620 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms