Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms