Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc7Q9D541 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc7Q9D541 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc7Q9D541 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms