Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox2aQ9D4Y3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhox2aQ9D4Y3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms