Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc83Q9D4V3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc83Q9D4V3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms