Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms