Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cul2Q9D4H8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms