Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubgcp4Q9D4F8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms