Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus10Q9D3U0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pus10Q9D3U0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus10Q9D3U0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms