Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stag1Q9D3E6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stag1Q9D3E6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms